由于整个疫情过程潜藏许多“政治病毒”，使得疫苗的采购一波三折，扑朔迷离。首因蔡英文倾力主导国产疫苗的研发和生产，而且预设1千万剂的施打目标，却引发诸多争议。二因疫苗采购涉及庞大商机，不只国内，更有国外因素纠结，包括美中疫苗外交战。
根据媒体报道，简单回溯疫苗采购波折：
1. 去年东洋制药就与德国BNT洽购疫苗，原拟订购3千万剂，后来“行政院”有“专家”建议只买2百万剂就好，交易因此泡汤。
2. 绿营某“立委”找信东制药与香港雅各臣洽议，据悉要以每剂45美元向“卫福部”报价，但遭上海复星总代理制止，交易未成。
3. 5月23日永龄基金会提出BNT疫苗捐赠方案，6月1日正式送件，受到政府冷落。
4. 6月10日台积电也暗中提出捐赠案。
5. 6月18日郭台铭脸书指明要见“总统”。蔡英文于当天下午同时约见台积电及郭台铭，会谈后宣布协助采购BNT。
6. 6月23日，慈济基金会呈送捐赠文件，26日证严上人与“总统”视讯。
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