他说，大陆在惩治“台独”，于法理上，如果逾越了从事分裂国家、顽固“台独”分子的条件，就是触犯22条《意见》并需要接受惩处，从政治目的看，法律规范也就是主权的展现，所以在海上执法方面也是相同的道理，大陆透过强势执法，彰显其行政管辖权，以具体行动对外宣示两岸事务是内政事务。
潘兆民认为，大陆现在处理两岸事务已经走向具体的法理层面，藉由法来展现主权。主权的展现具有政治目的，法律制定后则是主权的象征，大陆正在设法扩大其实质管辖权。一来吓阻“台独”，一来则对抗美国对台湾的长臂管辖，阻绝美国等西方势力介入台海事务。
不过，他说，换个角度来看，大陆透过具体的法理整治分离主义，也代表大陆尽量以非军事冲突的手段处理两岸问题，面对“台独”分裂行为的时候，可藉由法律的方式来处置，代表大陆仍未放弃和平统一的途径，若惩独《意见》能够产生效果，就未必须要动用武力攻台。
潘兆民认为，大陆仍然保留很多和平对话的空间，事实上，大陆方面会加压，并在法理上更为具体的展现底线原则，并在处理两岸关系方面不断凸显自主性，无论是在法理层面、军事层面、经贸层面乃至于执法层面，都按照其所设定的步调逐渐推进，硬的更硬、软的更软。
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