但是，大概最近的后十年多，随着两国关系越深入越扩大发展，在建交以后关系好的时候，并没有突出的或潜在的矛盾渐渐变为现实问题，各种摩擦和争议在媒体上越容易发酵可见。其中，最严重的摩擦，也就是2016-2017年间韩国为防卫朝鲜核导弹而设置美国支援的萨德反飞弹系统（THAAD）而引起的矛盾，形成了中国给韩国“经济报复”或“限韩令”的非常严重的后果。此后，“韩流”和“汉流”来表现的友好言论，变成为“反中”和“嫌韩”等互责言辞来代替。双方在1992年建交时候的当初友好之心为主的想法，随着内外环境的变化当中大大改变了。
现任文在寅政府，刚好2017年萨德问题的最严重的时候执政，文在寅总统为了稳定韩中两国关系以及改善对朝鲜关系，两国关系认定为“非对称权力关系”为前提之下，政治外交安全关系上，试图“友好”和“模糊”政策，访问中国约定“三不”来封顶“萨德问题”。韩国政府在升温中美矛盾之际，强调“经中安美”战略，以努力避险“站边困境”，希望保持韩中韩美关系稳定，虽然在中国一些专家赞扬那种中美之间兼顾的“韩国模式”，结果反而导致了韩中关系或韩美关系都不太“圆满”的情景。
如因“萨德问题”而中国采取的限制引进韩国大众文化的“限韩令”，到目前为止，也就是在文在寅政府任内，事实上没有圆满解决。最近有传闻，在韩国新总统选举之际，中国方面才有松动“限韩令”的迹象。
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